臭氧抗菌剂与生物液体接触后，能迅速释放出臭氧。 臭氧接触到生物液体（生理盐水、血浆、淋巴液、尿液）后，臭氧立即发生作用，进行反应,生成的原子氧（单氧原子）: O3+生物大分子->O2+O 生成氧分子和氧原子。
臭氧灭活病毒是直接破坏其RNA或者DNA遗传物质完成的。对细菌、真菌等病原微生物则是首先通过氧化破坏细菌膜，臭氧继续渗透细胞内并进一步破坏其细胞器而将其杀灭。
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